- پس از تأیید فرم‌ها، درخواست بررسی سوابق به مقامات مربوطه –شامل وزارت اطلاعات و آژانس‌های مجری قانون- و مراکز تأیید هویت ارسال می‌شود.
- اگر نتیجه بررسی سوابق مثبت باشد، پرونده به کمیته نظارت برگردانده می شود تا بررسی نهایی صورت گرفته و مجوز فعالیت در صورت تأیید صادر شود.
- سپس درخواست دهنده باید مجوز را به سازمان ثبت اسناد و املاک کشور ارائه کند که زیرمجموعه وزارت دادگستری است. در ادامه سازمان در پایگاه داده سازمان‌های مردم‌نهاد ثبت می‌شود.
در صورتی‌که درخواست رد شود، درخواست دهنده یک ماه فرصت دارد تا تقاضای تجدید نظر خود را به کمیته نظارت مقام بالاتر تقدیم کند. به عنوان مثال افرادی که درخواست آن‌ها توسط کمیته‌ای در سطح شهر رد شده است تقاضای تجدیدنظر خود را به کمیته نظارت استانداری تقدیم می‌کنند. به‌طور مشابه، افرادی که درخواست آن‌ها توسط کمیته استانی رد شده‌است تقاضای تجدیدنظر خود را به کمیته نظارت ملی وزارت کشور تقدیم می‌کنند. افرادی که درخواست آن‌ها در وزارت کشور رد شده‌است می‌توانند از دیوان عدالت اداری درخواست تجدید نظر کنند.
برای کسب اطلاعات بیشتر در‌خصوص چگونگی ثبت یک سازمان مردم‌نهاد به "مقدمه‌ای بر سازمان‌های مردم نهاد (NGO) در ایران" منتشر شده توسط نبض ایران مراجعه کنید.